Как оформлять агентское вознаграждение?

Добрый день!

Подскажите, пожалуйста!
Поставщик ОСНО выставляет документы на транспортные услуги организации на ОСНО:
- на свои услуги: с/ф и акт;
- на услуги выставленные ему РЖД: отчет комитенту, с/ф и акт о комиссионном вознаграждении (нулевой);
- на агентское вознаграждение: акт и с/ф. 
В договоре  указано, что клиент уплачивает исполнителю вознаграждение за оказание услуги по перевыставлению счетов, полученнных от РЖД в размере % от выставленного счета в том числе и НДС.
Получается услуги, выставляемые ему РЖД, мы принимаем как через РЖД. А вот агентское вознаграждение мы принимаем через РЖД или от него лично?
Извините, читаю договор и не могу понять.     

Благодарю за внимание.